脚气穿过的鞋中真菌存活时间受多种因素影响，一般在干燥通风环境下放置1-2周，真菌数量会显著减少，但要完全没有真菌则较难实现。若处于潮湿、温暖的环境，即使放置1个月以上，鞋内依然可能存在大量真菌，真菌在鞋内的存活时长与环境温湿度、鞋子材质以及清洁处理方式等密切相关。
从环境温湿度来看，真菌在温暖潮湿的环境中生命力顽强。当环境温度在22-36℃、相对湿度在90%左右时，真菌能够快速繁殖。若将有脚气的鞋子置于这样的环境，即便放置1-2个月，鞋内真菌依旧活跃。而在干燥、低温环境下，如温度低于10℃，相对湿度低于40%，真菌的生长繁殖会受到抑制，放置1-2周后，大部分真菌会因缺乏适宜生存条件而死亡，但仍可能有少量真菌孢子存活。鞋子材质对真菌存活时间影响明显，透气性差的塑料、人造革材质鞋子，容易积聚脚部汗水，形成高温高湿的内部环境，为真菌滋生提供温床。这类鞋子即使放置1-2个月，鞋内残留的真菌依然可能保持活性。而棉质、网面等透气性好的鞋子，能让空气流通，减少湿气积聚，在干燥通风处放置1-2周后，真菌数量会大幅下降，但完全消除真菌仍需进一步处理。是否经过清洁处理也决定鞋内真菌的残留情况，未经处理直接放置的鞋子，真菌会持续存活和繁殖。若对鞋子进行清洗、暴晒或消毒处理，能有效减少真菌数量。用含杀菌剂的洗涤剂清洗后，再放置在阳光下暴晒3-5天，大部分真菌会被杀灭；但如果仅简单放置，没有经过任何清洁消毒，鞋内真菌很难自行完全消失。
预防脚气真菌在鞋内残留的有效措施
1、日常清洁护理：每天脱下鞋子后，及时清理鞋内污垢，可使用鞋刷去除灰尘和皮屑。定期用含抗真菌成分的洗涤剂清洗鞋子，尤其是鞋垫、鞋内衬等易藏污纳垢的部位。
2、改善鞋子存放环境：选择干燥、通风的地方存放鞋子，避免将鞋子堆放在密闭、潮湿的鞋柜中。可在鞋柜内放置干燥剂，降低湿度；也可安装通风装置，保持空气流通。对于不常穿的鞋子，可使用鞋撑保持形状，并放入防潮袋中，进一步隔绝湿气。
3、定期消毒杀菌：每月至少对鞋子进行一次全面消毒。可使用紫外线消毒灯照射，利用紫外线破坏真菌的DNA结构；也可喷洒含酒精、次氯酸等成分的消毒剂，直接杀灭真菌。